Esta técnica se utilizo para investigar la hipertensión renal asociada y aprovechar los desarrollos recientes en la tecnología de microarrays, empleando microarrays lncRNA para detectar y comparar ncRNAs expresados diferencialmente en la corteza renal de ratas espontáneamente hipertensas (SHR) y ratas normotensas Wistar-Kyoto (WKY).
El microarreglo contenía aproximadamente 10.000 lncRNAs de rata que derivaban de bases de datos autorizadas, y la secuencia de datos que contenía 30.367 sondas de ARNm.
El análisis de Microarray indicó que 145 de 9991 ncRNAs se expresaron diferencialmente en SHR en comparación con las ratas WKY; de estos, 93 ncRNAs estaban regulados positivamente y 52 estaban regulados negativamente.
Se demostró que las secuencias incluidas tienen funciones que comienzan predominantemente con 'NR', como NR_038078.1, también denominado gen de hospedador de ARN nucleolar pequeño 4 (SNHG4), un gen que puede estar asociado con el efecto espectador en la biología de la radiación. Las secuencias incluidas también se asociaron funcionalmente con diversos ARN, pseudogenes, elementos ultraconservados y secuencias no clasificadas; usando los mismos criterios, se identificaron 383 ARN mensajeros coexpresados diferencialmente.
Referencias:
- Hou, L., Lin, Z., Ni, Y., Wu, Y., Chen, D., Song, L., Yang, D. Microarray expression profiling and gene ontology analysis of long non-coding RNAs in spontaneously hypertensive rats and their potential roles in the pathogenesis of hypertension. Molecular Medicine Reports, 13, 295-300. 2016. Consultado: 2017 dic 03. Disponible en: https://www.spandidos-publications.com/mmr/13/1/295
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